- BauNOW (2024-2026)
- New gOvernance for New spAces (NONA, 2024-2026)
- Innovative solutions for the efficient use of water in cross-border viticulture (Acquavitis, 2020-2022)
- Accessible Spaces for All (CE-Spaces4All, 2023-2026)
- ConnectIng hiSTorical Danube rEgions Roman routes (ISTER, 2020-2022)
- Evropski lokacijski okvir (ELF, 2013-2016)
- Ohranitev in promocija vodnih biotopov: kali in barjanska okna za prihodnost (LOKNA, 2015-2016)
- Harmonizacija Odprtih podatkov v MEditeRanu (HOMER, 2012-2015)
- Infrastrukturni in tehnološki potencial za vključevanje oseb s posebnimi potrebami v sistem vzgoje in izobraževanja (IPP, 2013-2015)
- Knjižnica slepih in slabovidnih (KSS, 2012-2015)
- Naravne nesreče brez meja (NH-WF, 2011-2014)
- Ocena privlačnosti območij v Jugovzhodni Evropi (ATTRACT-SEE, 2012-2014)
- Dvig socialnega in kulturnega kapitala v okoljih, kjer živijo predstavniki romske skupnosti (2010-2013)
- Transnacionalne ekološke mreže v Srednji Evropi (TransEcoNet, 2009-2012)
- Razširitev enciklopedije naravne in kulturne dediščine na Slovenskem (DEDI II, 2009-2010)
- Okoljsko in hidrološko upravljanje ter upravljanje z zemljišči: inovativne rešitve za območja (CADSES ENHYGMA, 2006-2008)
- Izdelava skupne metodologije za posodobitev in harmonizacijo geodetskih podlag za potrebe lokalnega prostorskega načrtovanja na obmejnem območju Slovenije in Italije (HARMO GEO, 2005-2007)
- Prostorski informacijski sistem za zaščitena območja in regije (SISTEMaPARC, 2004-2006)
- HARMO-DATA Harmonizacija podatkov za čezmejno upravljanje prostora (HARMO-DATA, 2014-2020)
- Attractive danube: Izboljšanje zmogljivosti javnih ustanov za večjo privlačnost območij podonavske regije (Attractive Danube, 2017-2019)